Concept information
Terme préférentiel
métagénétique
Définition(s)
- La métagénétique est une méthode d'analyse d'un échantillon de l'environnement qui permet de caractériser la diversité des espèces microbiennes d'un écosystème. On la considère comme « culture indépendante » car elle ne nécessite pas d'isoler et de cultiver les souches de bactéries ou de levures une à une de l'écosystème. L'ADN est extrait directement du levain. Un gène, ou une région d'un gène, est ensuite amplifié à partir de cet ADN et séquencé. On obtient ainsi un grand nombre de séquences qui proviennent des différentes espèces microbiennes du levain. Ces séquences sont assignées (affectées) à des espèces à l'aide de bases de données, ce qui permet de connaître la composition en espèces du levain. On parle de « métagénétique » car l'analyse se fait sur un gène ou une région ciblée du génome.
URI
http://opendata.inrae.fr/PAN/C_158
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